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基本情况

姓  名:

李翔宇

职  务:

硕士生导师

职  称:

讲师

学  历:

学  位:

博士

通信地址:

北京交通大学逸夫楼

邮  编:

100044

办公电话:

51684116

电子邮箱:

lixiangyu@bjtu.edu.cn

教育背景

2013.8~2019.7    清华大学自动化系,获工学博士学位(导师:张学工教授和张奇伟教授)

2009.8~2013.7    吉林大学数学学院统计专业,获理学学士学位

工作经历

2019.07-至今 北京交通大学 软件学院

2023.01-2024.01  英国剑桥Sanger研究所 访问学者

中国自动化学会智能健康与生物信息专委会委员

研究方向:生物信息学、机器学习



研究方向

  • 软件工程理论与技术
  • 人工智能与大数据
  • 软件服务工程
  • 智能交通领域软件工程
  • 软件工程

招生专业

  • 软件工程硕士

科研项目

国家自然科学基金青年项目: 整合单细胞转录组数据与空间转录组数据的细胞异质性分析方法, 2021-2023 (主持)

基本科研业务费人才基金: 单细胞组学数据的表示学习, 2019-2022 (主持)

教学工作

《人工智能基础》(本科课程)

《算法设计与实践》(本科课程)

《数据科学与知识发现》(研究生课程)

论文/期刊

Ÿ代表性论文(通讯作者#, 共同一作*):

[1] Li X, Chen W, Chen Y, Zhang X, Gu J#, Zhang Q. M#. (2017). Network embedding-based representation learning for single cell rna-seq data. Nucleic Acids Research, 45(19), e166.(IF=19.16)

[2] Guo T, Chen Y, Shi M, Li X#, Zhang Q. M#. (2022).Integration of single cell data by disentangled representation learning. Nucleic Acids Research, 50(2), e8. (IF=19.16)

[3] Wu G, Li X#, Guo W, Wei Z, Hu T, Shan Y, Gu J#(2022). JEBIN: analyzing gene co-expressions across multiple datasets by joint network embedding. Briefings in Bioinformatics, bbab603.(IF=13.994)

[4] Yan A*, Xiong J*, Zhu J*, Li X*,Xu S, Feng X,  Ke X, Wang Z, Chen Y, Wang H, Zhang, Q. M#, Kee K#. (2022).DAZL regulates proliferation of human primordial germ cell by direct binding to precursor miRNAs and enhances DICER processing activity. Nucleic Acids Research,gkac856 ( IF=19.16, 共同一作)

[5] Li X., & Chen W. (2021) Label Preserved Heterogeneous Network Embedding.  In International Conference on Neural Information Processing (pp. 121-132). Springer, Cham.





专著/译著

专利

软件著作权

获奖与荣誉

北京交通大学优秀主讲教师


学术报告 

07/2021  报告,中国生物工程学会第五届青年科技论坛

01/2021  邀请报告,北京协和医学院

04/2019  邀请报告,北京大学医学部,医学信息学系

02/2019  邀请报告,北京大学医学部,医学信息学系

01/2019  邀请报告,国家蛋白质科学中心·北京

11/2018  海报,Cold Spring Harbor Asia meeting on Frontiers in Single cell Genomics

10/2018  邀请报告,北京大学医学部,医学信息学系

08/2018  报告&海报,Pilot Projects for a Human Cell Atlas Europe Retreat

04/2018  邀请报告,北京大学医学部,医学信息学系

11/2017  邀请报告,中科院计算技术研究所

11/2016  海报,Cold Spring Harbor Asia meeting on Frontiers in Single cell Genomics















社会兼职

Briefings in Bioinformatics 审稿人

Genomics, Proteomics & Bioinformatics 审稿人

IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics 审稿人