姓  名：

包尔固德

职  务：

博士生导师

职  称：

教授

学  历：

研究生

学  位：

博士

通信地址：

逸夫楼西709

邮  编：

100044

办公电话：

51684116

电子邮箱：

baoe@bjtu.edu.cn

主要科研项目包括：基于DeepVariant的基因组测序序列纠错与组装、基因与体能关联知识图谱的构建与推理、基于时空数据挖掘的用户友好导航、基于多视角数据的人车交互行为深度预测，并且正在开发多个软件系统，计划招收1名博士、1名学硕、7名全日制专硕和5名非全日制专硕，欢迎联系！

2022.9.15：我接受21世纪经济报道的采访，对东数西算发表自己的看法！

2022.8.15：我们与广安门医院合作项目开启！

2022.7.15：我们与中车工业研究院合作项目开启！

2022.6.15：我们与中国人民解放军总医院合作项目开启！

2022.6.1：恭喜21级硕士生王磊、朱荣超、李杰、应禹尧等同学顺利入职字节跳动、华为、快手等公司！

2022.5.15：我接受贵阳网采访，对东数西算发表自己的看法！

2022.3.28：我被新增认定为专业型博士研究生导师，并被继续认定为学术型博士研究生导师！

2022.1.15：我们与中车工业研究院合作研发的模块化数据感知应用系统成功验收！

2022.1.1：恭喜21级硕士生王磊、朱荣超、李杰、应禹尧等同学成功获得阿里、快手、华为等公司offer！

2021.12.15：我晋升为正高级职称！

2021.12.1：我们为广安门医院干部保健病房设计开发的病例管理系统正式上线！

2021.10.15：恭喜博士生黄师恩在中科院一区期刊发表论文，并获得国家奖学金！

2021.8.15：我获得国家自然科学基金资助，获批“面上”项目一项！

2021.7.1：恭喜20级硕士生鲍康、彭室蓉、刘健楠、樊一航、何叶等同学顺利入职公务员单位、航天研究院和字节跳动等公司！

2009-2014年，美国加州大学河滨分校计算机与工程系，博士（导师：Tao Jiang教授和Thomas Girke教授）

2006-2009年，北京交通大学软件学院，硕士

2002-2006年，北京交通大学计算机与信息技术学院，本科

2014年至今，先后任北京交通大学软件学院副教授、博士生导师、交叉信息研究团队负责人（包括4名教师和20余名研究生）和教授

研究方向为基于大数据的算法和人工智能应用，应用领域主要包括智慧交通和智慧医疗

• 软件工程理论与技术
• 人工智能与大数据
• 软件服务工程
• 智能交通领域软件工程
• 软件工程
• 智能计算与大数据（软件学院导师组）

• 软件工程硕士
• 软件工程博士
• 人工智能博士

[1] 离散数学（本科课程）

[2] 软件体系结构（本科课程）

[3] 算法分析与证明（学硕课程；课程负责人）

[4] 计算理论（博士课程；课程负责人）

代表性论文（共同第一作者#，通讯作者*）：

[1] Shien Huang, Xinyu He, Guohua Wang*, Ergude Bao*. AlignGraph2: similar genome assisted reassembly pipeline for PacBio long reads. Briefings in Bioinformatics, 2021（顶级期刊）

[2] Ergude Bao*, Fei Xie, Changjin Song, Dandan Song*. FLAS: fast and high throughput algorithm for PacBio long read self-correction. Bioinformatics (special track for RECOMB-Seq), 2019（顶级期刊）

[3] Ergude Bao#*, Changjin Song#, Lingxiao Lan. ReMILO: reference assisted misassembly detection algorithm using short and long reads. Bioinformatics. 2018（顶级期刊）

[4] Ergude Bao#*, Lingxiao Lan#. HALC: High throughput algorithm for long read error correction. BMC Bioinformatics, 2017（被引60次）

[5] Ergude Bao, Tao Jiang, Thomas Girke*. AlignGraph: algorithm for secondary de novo genome assembly guided by closely related references. Bioinformatics (special issue for ISMB), 2014（顶级期刊）

[6] Ergude Bao, Tao Jiang, Thomas Girke*. BRANCH: boosting RNA-Seq assemblies with partial or related genomic sequences. Bioinformatics, 2013（顶级期刊）

[7] Ergude Bao, Tao Jiang, Isgouhi Kaloshian, Thomas Girke*. SEED: efficient clustering of next generation sequences. Bioinformatics, 2011（顶级期刊）

[8] 包尔固德*, 李伟生, 范东睿, 杨扬, 马啸宇. Godson-T众核体系结构上的Broadcast性能优化. 计算机研究与发展, 2010（顶级中文期刊）

[9] 张力天, 樊一航, 范灵俊, 包尔固德*. 基于宏微观因素的概率级别的车辆事故预测. 计算机研究与发展, 2020（顶级中文期刊）

[10] Zhihao Zheng#, Xiaodong Lin#, Ming Yang#, Zeming He, Ergude Bao*, Hang Zhang*, Zhenyu Tian*. Progress in the application of machine learning in combustion studies. ES Energy & Environment, 2020

[11] Zeming He#, Ming Yang#, Lei Wang, Ergude Bao*, Hang Zhang*. Concentrated photovoltaic thermoelectric hybrid system: an experimental and machine learning study. Engineered Science, 2021

[1] 马啸宇, 范东睿, 包尔固德, 张轮凯. Multi-core or numerous-core processor function verification device and method. 发明专利, 2010

[2] 包尔固德, 张子开, 孟鑫磊, 王鹏, 杨瑛. 一种扫码开启的消耗品共享装置. 实用新型, 2017

[3] 申倩雯, 刘琦, 田寅, 唐海川, 包尔固德. 基于深度学习的新能源车电池自燃预警方法及装置. 发明专利, 2022

[1] 包尔固德, 汪国华. 相似基因组辅助的长读长重拼接软件 [简称: AlignGraph2] V1.0. 2021

[2] 包尔固德. 高通量的长读长纠错软件 [简称: HALC] V1.0. 2021

[3] 包尔固德. 锂离子电池可视化管理系统 V1.0. 2021

[4] 沈晓宇, 黄师恩, 包尔固德. 模块化数据感知系统 V1.0. 2021

[5] 包尔固德, 申倩雯. 交通用锂离子电池自燃预警软件 V1.0. 2022

[1] 2019年在第六届计算生物学与生物信息学学术会议作特邀报告 

[2] 2018年在湖南师范大学作特邀报告

[3] 2018年在第七届生物信息青年PI研讨会作特邀报告

[4] 2017年在东北林业大学作特邀报告

[5] 2015年入选北京交通大学青年英才计划

[6] 2019年接受中国教育电视台采访：http://m.cetv.cn/p/340291.html

[7] 2022年接受贵阳网采访：http://www.gywb.cn/system/2022/05/26/041401210.shtml

[8] 2022年接受21世纪经济报道采访：https://m.21jingji.com/article/20220907/herald/a5ded25a1c5c8f1979629bc78dfdf741.html

[1] 国家自然科学基金评审人（评审面上项目2次）

[2] 各类期刊会议审稿人（评审各类论文30余次，包括Nature子刊Nature Biotechnology）

[3] 期刊特刊主编（顶级期刊Frontiers in Plant Science）

[4] 中小微企业项目顾问（共计3家）

2017年：兰凌潇（本科：电子科技大学，论文发表：中科院一区1篇二区1篇，工作单位：字节跳动）

2018年：宋长进（本科：北京理工大学，论文发表：中科院一区2篇，工作单位：首汽约车）

2019年：黄师恩（本科：北京交通大学，论文发表：中科院一区1篇，工作单位：本实验室读博）

2020年：何欣雨（本科：北京交通大学，论文发表：中科院一区1篇，工作单位：中国农业银行）